Pochází z Prahy, studoval soukromě kontrapunkt a základy kompozice u českého skladatele prof. Františka Kovaříčka. Hru na cembalo a generálbas studoval u izraelského cembalisty Shaleva Ad-El. Kromě toho se zúčastnil mistrovských kurzů ve Franci (Printemps des Arts v Nantes, Rencontre Musical na zámku Villarceux u Paříže) a v Německu (Internationale Händel-Akademie v Karlsruhe, Akademie für Alte Musik v Drážďanech). Na pražské Universitě Karlově studoval hudební vědu, studia dokončil na Masarykově univerzitě v Brně. V letech 1996–1999 vyučoval hru generálbasu a komorní hru na Akademii staré hudby při Masarykově universitě v Brně, v letech 2008–2011 vedl kursy barokní hudby na Církevní konzervatoři v Opavě. Od roku 1996 působí na zámku v Českém Krumlově, kde spolupracuje s Nadací barokního divadla při výzkumu v oblasti interpretace barokní opery. V roce 1991 založil soubor Cappella Accademica, v roce 2005 pak mezinárodní vokálně instrumentální soubor Hof-Musici, specializovaný na interpretaci barokní hudby. Hlavní badatelský i interpretační zájem Ondřeje Macka patří kantátě, oratoriu a opeře italského baroka. Věnuje se přitom zejména vyhledávání neznámých skladeb dochovaných v evropských knihovnách a archivech. Je spoluzakladatelem a uměleckým vedoucím Festivalu barokních umění a Centra barokní kultury v Českém Krumlově. Od roku 2018 spolupracuje s britsko-italským projektem rekonstrukce prvního operního divadla na světě – Teatro San Cassiano v Benátkách. Od roku 2025 působí na Konzervatoři v Českých Budějovicích.